Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SART1O43290 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SART1O43290 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SART1O43290 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SART1O43290 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SART1O43290 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SART1O43290 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SART1O43290 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SART1O43290 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SART1O43290 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SART1O43290 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SART1O43290 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SART1O43290 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SART1O43290 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SART1O43290 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SART1O43290 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SART1O43290 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SART1O43290 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SART1O43290 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SART1O43290 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SART1O43290 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SART1O43290 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SART1O43290 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SART1O43290 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SART1O43290 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SART1O43290 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SART1O43290 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SART1O43290 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SART1O43290 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SART1O43290 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SART1O43290 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SART1O43290 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SART1O43290 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SART1O43290 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SART1O43290 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SART1O43290 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SART1O43290 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SART1O43290 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SART1O43290 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SART1O43290 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SART1O43290 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SART1O43290 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SART1O43290 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SART1O43290 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SART1O43290 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SART1O43290 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SART1O43290 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SART1O43290 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SART1O43290 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SART1O43290 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SART1O43290 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SART1O43290 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SART1O43290 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SART1O43290 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SART1O43290 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SART1O43290 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SART1O43290 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SART1O43290 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SART1O43290 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SART1O43290 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SART1O43290 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SART1O43290 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SART1O43290 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SART1O43290 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SART1O43290 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SART1O43290 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms