Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL11Q9NVR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL11Q9NVR0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL11Q9NVR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL11Q9NVR0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL11Q9NVR0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms