RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380244.7

FUS-202, Transcript of FUS RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FUS, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUS-202ENST00000380244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.31■■■■■ 6.61
FUS-202ENST00000380244 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.29■■■■■ 5.48
FUS-202ENST00000380244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
FUS-202ENST00000380244 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.66■■■■■ 5.06
FUS-202ENST00000380244 ABCC9O60706 1549 aa46.56■■■■■ 5.04
FUS-202ENST00000380244 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.3■■■■■ 5
FUS-202ENST00000380244 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.2■■■■■ 4.99
FUS-202ENST00000380244 NACADO15069 1562 aa45.91■■■■■ 4.94
FUS-202ENST00000380244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.58■■■■■ 4.89
FUS-202ENST00000380244 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.53■■■■■ 4.88
FUS-202ENST00000380244 SCRIBQ14160 1630 aa45.14■■■■■ 4.82
FUS-202ENST00000380244 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.64■■■■■ 4.74
FUS-202ENST00000380244 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.16■■■■■ 4.66
FUS-202ENST00000380244 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.8■■■■■ 4.65e-12■■■■□ 24.4
FUS-202ENST00000380244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
FUS-202ENST00000380244 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.69■■■■■ 4.58
FUS-202ENST00000380244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
FUS-202ENST00000380244 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
FUS-202ENST00000380244 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.45■■■■■ 4.55
FUS-202ENST00000380244 SMARCA4P51532 1647 aa43.34■■■■■ 4.53
FUS-202ENST00000380244 WIZO95785 1651 aa43.1■■■■■ 4.49
FUS-202ENST00000380244 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.89■■■■■ 4.46
FUS-202ENST00000380244 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
FUS-202ENST00000380244 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
FUS-202ENST00000380244 SMARCA2P51531 1590 aa42.66■■■■■ 4.42
FUS-202ENST00000380244 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.64■■■■■ 4.42
FUS-202ENST00000380244 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
FUS-202ENST00000380244 NCAPD3P42695 1498 aa42.34■■■■■ 4.37
FUS-202ENST00000380244 HMGXB3Q12766 1538 aa42.31■■■■■ 4.36
FUS-202ENST00000380244 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.22■■■■■ 4.35
FUS-202ENST00000380244 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.2■■■■■ 4.35
FUS-202ENST00000380244 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.89■■■■■ 4.3
FUS-202ENST00000380244 CFTRP13569 1480 aa41.34■■■■■ 4.21
FUS-202ENST00000380244 TRIM41Q8WV44 630 aa41.23■■■■■ 4.19
FUS-202ENST00000380244 PRDM2Q13029 1718 aa41.22■■■■■ 4.19
FUS-202ENST00000380244 ABCC8Q09428 1581 aa41.21■■■■■ 4.19
FUS-202ENST00000380244 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.19■■■■■ 4.19
FUS-202ENST00000380244 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.18■■■■■ 4.18
FUS-202ENST00000380244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.01■■■■■ 4.167e-6■□□□□ 9.3
FUS-202ENST00000380244 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.96■■■■■ 4.15
FUS-202ENST00000380244 SYNJ1O43426 1573 aa40.87■■■■■ 4.13
FUS-202ENST00000380244 NESP48681 1621 aa40.84■■■■■ 4.13
FUS-202ENST00000380244 TOP2BQ02880 1626 aa40.77■■■■■ 4.12
FUS-202ENST00000380244 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.76■■■■■ 4.11
FUS-202ENST00000380244 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.73■■■■■ 4.11
FUS-202ENST00000380244 CUX1P39880 1505 aa40.66■■■■■ 4.1
FUS-202ENST00000380244 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.59■■■■■ 4.09
FUS-202ENST00000380244 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.51■■■■■ 4.08
FUS-202ENST00000380244 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.43■■■■■ 4.06
FUS-202ENST00000380244 EEA1Q15075 1411 aa40.39■■■■■ 4.06
FUS-202ENST00000380244 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.39■■■■■ 4.06
FUS-202ENST00000380244 SOGA1O94964 1423 aa40.39■■■■■ 4.06
FUS-202ENST00000380244 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
FUS-202ENST00000380244 TOPBP1Q92547 1522 aa40.3■■■■■ 4.04
FUS-202ENST00000380244 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
FUS-202ENST00000380244 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.24■■■■■ 4.03
FUS-202ENST00000380244 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.23■■■■■ 4.03
FUS-202ENST00000380244 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.19■■■■■ 4.02
FUS-202ENST00000380244 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.08■■■■■ 4.01
FUS-202ENST00000380244 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.08■■■■■ 4.01
FUS-202ENST00000380244 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
FUS-202ENST00000380244 KIF27Q86VH2 1401 aa40■■■■□ 3.99
FUS-202ENST00000380244 ERCC6Q03468 1493 aa39.96■■■■□ 3.99
FUS-202ENST00000380244 WDR62O43379 1518 aa39.92■■■■□ 3.98
FUS-202ENST00000380244 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.92■■■■□ 3.98
FUS-202ENST00000380244 CUX2O14529 1486 aa39.91■■■■□ 3.98
FUS-202ENST00000380244 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
FUS-202ENST00000380244 KIF21BO75037 1637 aa39.88■■■■□ 3.98
FUS-202ENST00000380244 WDR97A6NE52 1622 aa39.86■■■■□ 3.97
FUS-202ENST00000380244 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
FUS-202ENST00000380244 GOLGA3Q08378 1498 aa39.77■■■■□ 3.96
FUS-202ENST00000380244 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
FUS-202ENST00000380244 PRXQ9BXM0 1461 aa39.72■■■■□ 3.95
FUS-202ENST00000380244 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.71■■■■□ 3.95
FUS-202ENST00000380244 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.66■■■■□ 3.94
FUS-202ENST00000380244 IGF1RP08069 1367 aa39.65■■■■□ 3.94
FUS-202ENST00000380244 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.63■■■■□ 3.93
FUS-202ENST00000380244 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.61■■■■□ 3.93
FUS-202ENST00000380244 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.6■■■■□ 3.93
FUS-202ENST00000380244 IFT140Q96RY7 1462 aa39.57■■■■□ 3.93
FUS-202ENST00000380244 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.5■■■■□ 3.91
FUS-202ENST00000380244 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
FUS-202ENST00000380244 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
FUS-202ENST00000380244 CUL7Q14999 1698 aa39.45■■■■□ 3.91
FUS-202ENST00000380244 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.43■■■■□ 3.9
FUS-202ENST00000380244 CEP162Q5TB80 1403 aa39.36■■■■□ 3.89
FUS-202ENST00000380244 PBRM1Q86U86 1689 aa39.35■■■■□ 3.89
FUS-202ENST00000380244 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
FUS-202ENST00000380244 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.884e-7■■■■□ 23.6
FUS-202ENST00000380244 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
FUS-202ENST00000380244 GRIN2BQ13224 1484 aa39.23■■■■□ 3.87
FUS-202ENST00000380244 ADAMTS12P58397 1594 aa39.11■■■■□ 3.85
FUS-202ENST00000380244 CLIP1P30622 1438 aa39.09■■■■□ 3.85
FUS-202ENST00000380244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.08■■■■□ 3.85
FUS-202ENST00000380244 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.99■■■■□ 3.83
FUS-202ENST00000380244 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.96■■■■□ 3.83
FUS-202ENST00000380244 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
FUS-202ENST00000380244 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.79■■■■□ 3.8
FUS-202ENST00000380244 SYNJ2O15056 1496 aa38.78■■■■□ 3.8
FUS-202ENST00000380244 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
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