Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDNQ99608 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDNQ99608 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDNQ99608 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDNQ99608 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDNQ99608 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NDNQ99608 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDNQ99608 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDNQ99608 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDNQ99608 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDNQ99608 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDNQ99608 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDNQ99608 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDNQ99608 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NDNQ99608 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDNQ99608 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDNQ99608 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDNQ99608 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDNQ99608 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDNQ99608 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDNQ99608 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDNQ99608 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDNQ99608 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDNQ99608 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDNQ99608 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDNQ99608 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDNQ99608 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDNQ99608 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDNQ99608 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDNQ99608 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDNQ99608 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDNQ99608 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDNQ99608 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDNQ99608 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NDNQ99608 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDNQ99608 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDNQ99608 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDNQ99608 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDNQ99608 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDNQ99608 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDNQ99608 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDNQ99608 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDNQ99608 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDNQ99608 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDNQ99608 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDNQ99608 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NDNQ99608 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDNQ99608 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDNQ99608 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDNQ99608 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDNQ99608 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDNQ99608 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDNQ99608 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDNQ99608 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NDNQ99608 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDNQ99608 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NDNQ99608 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDNQ99608 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDNQ99608 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDNQ99608 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDNQ99608 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDNQ99608 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDNQ99608 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDNQ99608 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDNQ99608 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDNQ99608 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDNQ99608 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDNQ99608 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDNQ99608 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDNQ99608 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDNQ99608 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDNQ99608 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDNQ99608 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDNQ99608 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms