Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDAP1Q13442 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDAP1Q13442 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDAP1Q13442 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDAP1Q13442 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms