Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMAD9O15198 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMAD9O15198 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAD9O15198 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAD9O15198 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms