Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R1LQ9P1A2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP4R1LQ9P1A2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4R1LQ9P1A2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R1LQ9P1A2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms