Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPP4R1LQ9P1A2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PPP4R1LQ9P1A2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPP4R1LQ9P1A2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
PPP4R1LQ9P1A2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PPP4R1LQ9P1A2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPP4R1LQ9P1A2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPP4R1LQ9P1A2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PPP4R1LQ9P1A2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PPP4R1LQ9P1A2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PPP4R1LQ9P1A2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPP4R1LQ9P1A2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPP4R1LQ9P1A2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPP4R1LQ9P1A2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP4R1LQ9P1A2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP4R1LQ9P1A2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP4R1LQ9P1A2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R1LQ9P1A2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP4R1LQ9P1A2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP4R1LQ9P1A2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP4R1LQ9P1A2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP4R1LQ9P1A2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP4R1LQ9P1A2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP4R1LQ9P1A2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R1LQ9P1A2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPP4R1LQ9P1A2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP4R1LQ9P1A2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP4R1LQ9P1A2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP4R1LQ9P1A2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP4R1LQ9P1A2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R1LQ9P1A2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP4R1LQ9P1A2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R1LQ9P1A2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R1LQ9P1A2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP4R1LQ9P1A2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPP4R1LQ9P1A2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R1LQ9P1A2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPP4R1LQ9P1A2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R1LQ9P1A2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R1LQ9P1A2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R1LQ9P1A2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R1LQ9P1A2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP4R1LQ9P1A2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R1LQ9P1A2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP4R1LQ9P1A2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP4R1LQ9P1A2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP4R1LQ9P1A2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPP4R1LQ9P1A2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPP4R1LQ9P1A2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4R1LQ9P1A2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP4R1LQ9P1A2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP4R1LQ9P1A2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP4R1LQ9P1A2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPP4R1LQ9P1A2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPP4R1LQ9P1A2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPP4R1LQ9P1A2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPP4R1LQ9P1A2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPP4R1LQ9P1A2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP4R1LQ9P1A2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPP4R1LQ9P1A2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPP4R1LQ9P1A2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R1LQ9P1A2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R1LQ9P1A2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R1LQ9P1A2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PPP4R1LQ9P1A2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPP4R1LQ9P1A2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R1LQ9P1A2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPP4R1LQ9P1A2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R1LQ9P1A2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPP4R1LQ9P1A2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPP4R1LQ9P1A2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP4R1LQ9P1A2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP4R1LQ9P1A2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP4R1LQ9P1A2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R1LQ9P1A2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP4R1LQ9P1A2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP4R1LQ9P1A2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP4R1LQ9P1A2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP4R1LQ9P1A2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP4R1LQ9P1A2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP4R1LQ9P1A2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP4R1LQ9P1A2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP4R1LQ9P1A2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP4R1LQ9P1A2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPP4R1LQ9P1A2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPP4R1LQ9P1A2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PPP4R1LQ9P1A2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPP4R1LQ9P1A2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPP4R1LQ9P1A2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPP4R1LQ9P1A2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPP4R1LQ9P1A2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP4R1LQ9P1A2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPP4R1LQ9P1A2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPP4R1LQ9P1A2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP4R1LQ9P1A2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPP4R1LQ9P1A2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPP4R1LQ9P1A2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPP4R1LQ9P1A2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPP4R1LQ9P1A2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209 ms