Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC6A20Q9NP91 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC6A20Q9NP91 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A20Q9NP91 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A20Q9NP91 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms