Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J7

SLC6A15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A15Q9H2J7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC6A15Q9H2J7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A15Q9H2J7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A15Q9H2J7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A15Q9H2J7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms