RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.71■■■■■ 6.99
NTN3-201ENST00000293973 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.65■■■■■ 5.86
NTN3-201ENST00000293973 ABCC9O60706 1549 aa49.46■■■■■ 5.51
NTN3-201ENST00000293973 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
NTN3-201ENST00000293973 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.64■■■■■ 5.38
NTN3-201ENST00000293973 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.59■■■■■ 5.37
NTN3-201ENST00000293973 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.34■■■■■ 5.33
NTN3-201ENST00000293973 NACADO15069 1562 aa48.27■■■■■ 5.32
NTN3-201ENST00000293973 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.05■■■■■ 5.28
NTN3-201ENST00000293973 SCRIBQ14160 1630 aa47.3■■■■■ 5.16
NTN3-201ENST00000293973 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.2■■■■■ 5.15
NTN3-201ENST00000293973 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.06■■■■■ 5.12
NTN3-201ENST00000293973 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.58■■■■■ 5.05
NTN3-201ENST00000293973 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.44■■■■■ 5.02
NTN3-201ENST00000293973 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.63■■■■■ 4.9
NTN3-201ENST00000293973 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
NTN3-201ENST00000293973 SMARCA4P51532 1647 aa45.32■■■■■ 4.85
NTN3-201ENST00000293973 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.3■■■■■ 4.84
NTN3-201ENST00000293973 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
NTN3-201ENST00000293973 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
NTN3-201ENST00000293973 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
NTN3-201ENST00000293973 WIZO95785 1651 aa44.89■■■■■ 4.78
NTN3-201ENST00000293973 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.82■■■■■ 4.77
NTN3-201ENST00000293973 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.79■■■■■ 4.76
NTN3-201ENST00000293973 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.75■■■■■ 4.75
NTN3-201ENST00000293973 SMARCA2P51531 1590 aa44.75■■■■■ 4.75
NTN3-201ENST00000293973 NCAPD3P42695 1498 aa44.53■■■■■ 4.72
NTN3-201ENST00000293973 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
NTN3-201ENST00000293973 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.7
NTN3-201ENST00000293973 HMGXB3Q12766 1538 aa44.43■■■■■ 4.7
NTN3-201ENST00000293973 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.39■■■■■ 4.7
NTN3-201ENST00000293973 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.92■■■■■ 4.62
NTN3-201ENST00000293973 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.31■■■■■ 4.52
NTN3-201ENST00000293973 CFTRP13569 1480 aa43.31■■■■■ 4.52
NTN3-201ENST00000293973 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
NTN3-201ENST00000293973 NESP48681 1621 aa43.17■■■■■ 4.5
NTN3-201ENST00000293973 PRDM2Q13029 1718 aa43.12■■■■■ 4.49
NTN3-201ENST00000293973 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.84■■■■■ 4.45
NTN3-201ENST00000293973 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.83■■■■■ 4.45
NTN3-201ENST00000293973 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
NTN3-201ENST00000293973 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.7■■■■■ 4.43
NTN3-201ENST00000293973 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.67■■■■■ 4.42
NTN3-201ENST00000293973 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.67■■■■■ 4.42
NTN3-201ENST00000293973 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.58■■■■■ 4.41
NTN3-201ENST00000293973 ERCC6Q03468 1493 aa42.53■■■■■ 4.4
NTN3-201ENST00000293973 SYNJ1O43426 1573 aa42.44■■■■■ 4.38
NTN3-201ENST00000293973 CUX1P39880 1505 aa42.43■■■■■ 4.38
NTN3-201ENST00000293973 TRIM41Q8WV44 630 aa42.41■■■■■ 4.38
NTN3-201ENST00000293973 TOP2BQ02880 1626 aa42.37■■■■■ 4.37
NTN3-201ENST00000293973 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.35■■■■■ 4.37
NTN3-201ENST00000293973 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.34■■■■■ 4.37
NTN3-201ENST00000293973 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
NTN3-201ENST00000293973 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.33■■■■■ 4.37
NTN3-201ENST00000293973 TOPBP1Q92547 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
NTN3-201ENST00000293973 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
NTN3-201ENST00000293973 WDR62O43379 1518 aa42.16■■■■■ 4.34
NTN3-201ENST00000293973 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.09■■■■■ 4.33
NTN3-201ENST00000293973 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
NTN3-201ENST00000293973 SOGA1O94964 1423 aa41.84■■■■■ 4.29
NTN3-201ENST00000293973 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.83■■■■■ 4.29
NTN3-201ENST00000293973 CUX2O14529 1486 aa41.81■■■■■ 4.28
NTN3-201ENST00000293973 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
NTN3-201ENST00000293973 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.72■■■■■ 4.27
NTN3-201ENST00000293973 IFT140Q96RY7 1462 aa41.7■■■■■ 4.27
NTN3-201ENST00000293973 WDR97A6NE52 1622 aa41.69■■■■■ 4.26
NTN3-201ENST00000293973 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.62■■■■■ 4.25
NTN3-201ENST00000293973 KIF27Q86VH2 1401 aa41.59■■■■■ 4.25
NTN3-201ENST00000293973 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
NTN3-201ENST00000293973 EEA1Q15075 1411 aa41.56■■■■■ 4.24
NTN3-201ENST00000293973 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
NTN3-201ENST00000293973 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.46■■■■■ 4.23
NTN3-201ENST00000293973 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
NTN3-201ENST00000293973 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.4■■■■■ 4.22
NTN3-201ENST00000293973 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.37■■■■■ 4.21
NTN3-201ENST00000293973 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.36■■■■■ 4.21
NTN3-201ENST00000293973 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
NTN3-201ENST00000293973 IGF1RP08069 1367 aa41.27■■■■■ 4.2
NTN3-201ENST00000293973 PBRM1Q86U86 1689 aa41.26■■■■■ 4.2
NTN3-201ENST00000293973 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.24■■■■■ 4.19
NTN3-201ENST00000293973 GRIN2BQ13224 1484 aa41.21■■■■■ 4.19
NTN3-201ENST00000293973 CUL7Q14999 1698 aa41.11■■■■■ 4.17
NTN3-201ENST00000293973 PRXQ9BXM0 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
NTN3-201ENST00000293973 KIF21BO75037 1637 aa41.07■■■■■ 4.17
NTN3-201ENST00000293973 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.06■■■■■ 4.16
NTN3-201ENST00000293973 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.02■■■■■ 4.16
NTN3-201ENST00000293973 ADAMTS12P58397 1594 aa40.98■■■■■ 4.15
NTN3-201ENST00000293973 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.97■■■■■ 4.15
NTN3-201ENST00000293973 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
NTN3-201ENST00000293973 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.96■■■■■ 4.15
NTN3-201ENST00000293973 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.95■■■■■ 4.15
NTN3-201ENST00000293973 GOLGA3Q08378 1498 aa40.94■■■■■ 4.14
NTN3-201ENST00000293973 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.94■■■■■ 4.14
NTN3-201ENST00000293973 SYNJ2O15056 1496 aa40.8■■■■■ 4.12
NTN3-201ENST00000293973 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
NTN3-201ENST00000293973 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
NTN3-201ENST00000293973 GRIN2AQ12879 1464 aa40.7■■■■■ 4.11
NTN3-201ENST00000293973 FBLN2P98095 1184 aa40.66■■■■■ 4.1
NTN3-201ENST00000293973 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.62■■■■■ 4.09
NTN3-201ENST00000293973 CHD1O14646 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
NTN3-201ENST00000293973 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.53■■■■■ 4.08
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