RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527043.5

SYT12-205, Transcript of synaptotagmin 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT12, Length 1,661 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12-205ENST00000527043 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.78■■■■■ 7
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SYT12-205ENST00000527043 ABCC9O60706 1549 aa49.29■■■■■ 5.48
SYT12-205ENST00000527043 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
SYT12-205ENST00000527043 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.65■■■■■ 5.38
SYT12-205ENST00000527043 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.57■■■■■ 5.37
SYT12-205ENST00000527043 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.31■■■■■ 5.32
SYT12-205ENST00000527043 NACADO15069 1562 aa48.23■■■■■ 5.31
SYT12-205ENST00000527043 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48■■■■■ 5.27
SYT12-205ENST00000527043 SCRIBQ14160 1630 aa47.39■■■■■ 5.18
SYT12-205ENST00000527043 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.39■■■■■ 5.18
SYT12-205ENST00000527043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.1■■■■■ 5.13
SYT12-205ENST00000527043 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.51■■■■■ 5.04
SYT12-205ENST00000527043 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.23■■■■■ 4.99
SYT12-205ENST00000527043 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.65■■■■■ 4.9
SYT12-205ENST00000527043 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
SYT12-205ENST00000527043 SMARCA4P51532 1647 aa45.4■■■■■ 4.86
SYT12-205ENST00000527043 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.37■■■■■ 4.85
SYT12-205ENST00000527043 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
SYT12-205ENST00000527043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.23■■■■■ 4.83
SYT12-205ENST00000527043 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
SYT12-205ENST00000527043 WIZO95785 1651 aa45.03■■■■■ 4.8
SYT12-205ENST00000527043 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.85■■■■■ 4.77
SYT12-205ENST00000527043 SMARCA2P51531 1590 aa44.76■■■■■ 4.76
SYT12-205ENST00000527043 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.7■■■■■ 4.75
SYT12-205ENST00000527043 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.67■■■■■ 4.74
SYT12-205ENST00000527043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
SYT12-205ENST00000527043 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
SYT12-205ENST00000527043 HMGXB3Q12766 1538 aa44.43■■■■■ 4.7
SYT12-205ENST00000527043 NCAPD3P42695 1498 aa44.42■■■■■ 4.7
SYT12-205ENST00000527043 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.99■■■■■ 4.63
SYT12-205ENST00000527043 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.87■■■■■ 4.61
SYT12-205ENST00000527043 PRDM2Q13029 1718 aa43.29■■■■■ 4.52
SYT12-205ENST00000527043 CFTRP13569 1480 aa43.28■■■■■ 4.52
SYT12-205ENST00000527043 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.21■■■■■ 4.51
SYT12-205ENST00000527043 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.13■■■■■ 4.49
SYT12-205ENST00000527043 NESP48681 1621 aa43.07■■■■■ 4.48
SYT12-205ENST00000527043 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.95■■■■■ 4.47
SYT12-205ENST00000527043 ABCC8Q09428 1581 aa42.92■■■■■ 4.46
SYT12-205ENST00000527043 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.8■■■■■ 4.44
SYT12-205ENST00000527043 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.73■■■■■ 4.43
SYT12-205ENST00000527043 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.71■■■■■ 4.43
SYT12-205ENST00000527043 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.69■■■■■ 4.42
SYT12-205ENST00000527043 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.64■■■■■ 4.42
SYT12-205ENST00000527043 SYNJ1O43426 1573 aa42.6■■■■■ 4.41
SYT12-205ENST00000527043 TRIM41Q8WV44 630 aa42.6■■■■■ 4.41
SYT12-205ENST00000527043 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.52■■■■■ 4.4
SYT12-205ENST00000527043 TOP2BQ02880 1626 aa42.51■■■■■ 4.4
SYT12-205ENST00000527043 CUX1P39880 1505 aa42.49■■■■■ 4.39
SYT12-205ENST00000527043 ERCC6Q03468 1493 aa42.39■■■■■ 4.38
SYT12-205ENST00000527043 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.37■■■■■ 4.37
SYT12-205ENST00000527043 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
SYT12-205ENST00000527043 TOPBP1Q92547 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
SYT12-205ENST00000527043 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.27■■■■■ 4.36
SYT12-205ENST00000527043 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
SYT12-205ENST00000527043 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.13■■■■■ 4.33
SYT12-205ENST00000527043 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
SYT12-205ENST00000527043 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
SYT12-205ENST00000527043 SOGA1O94964 1423 aa41.88■■■■■ 4.29
SYT12-205ENST00000527043 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.81■■■■■ 4.28
SYT12-205ENST00000527043 WDR97A6NE52 1622 aa41.8■■■■■ 4.28
SYT12-205ENST00000527043 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
SYT12-205ENST00000527043 EEA1Q15075 1411 aa41.77■■■■■ 4.28
SYT12-205ENST00000527043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.76■■■■■ 4.28
SYT12-205ENST00000527043 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
SYT12-205ENST00000527043 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.74■■■■■ 4.27
SYT12-205ENST00000527043 CUX2O14529 1486 aa41.72■■■■■ 4.27
SYT12-205ENST00000527043 KIF27Q86VH2 1401 aa41.67■■■■■ 4.26
SYT12-205ENST00000527043 IFT140Q96RY7 1462 aa41.63■■■■■ 4.25
SYT12-205ENST00000527043 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.54■■■■■ 4.24
SYT12-205ENST00000527043 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.47■■■■■ 4.23
SYT12-205ENST00000527043 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
SYT12-205ENST00000527043 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.39■■■■■ 4.22
SYT12-205ENST00000527043 PBRM1Q86U86 1689 aa41.38■■■■■ 4.22
SYT12-205ENST00000527043 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
SYT12-205ENST00000527043 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
SYT12-205ENST00000527043 KIF21BO75037 1637 aa41.34■■■■■ 4.21
SYT12-205ENST00000527043 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
SYT12-205ENST00000527043 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.28■■■■■ 4.2
SYT12-205ENST00000527043 IGF1RP08069 1367 aa41.26■■■■■ 4.2
SYT12-205ENST00000527043 CUL7Q14999 1698 aa41.25■■■■■ 4.19
SYT12-205ENST00000527043 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.22■■■■■ 4.19
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SYT12-205ENST00000527043 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.19■■■■■ 4.18
SYT12-205ENST00000527043 GOLGA3Q08378 1498 aa41.18■■■■■ 4.18
SYT12-205ENST00000527043 GRIN2BQ13224 1484 aa41.18■■■■■ 4.18
SYT12-205ENST00000527043 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.11■■■■■ 4.17
SYT12-205ENST00000527043 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.09■■■■■ 4.17
SYT12-205ENST00000527043 ADAMTS12P58397 1594 aa41.05■■■■■ 4.16
SYT12-205ENST00000527043 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.99■■■■■ 4.15
SYT12-205ENST00000527043 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
SYT12-205ENST00000527043 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.93■■■■■ 4.14
SYT12-205ENST00000527043 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
SYT12-205ENST00000527043 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.83■■■■■ 4.13
SYT12-205ENST00000527043 SYNJ2O15056 1496 aa40.76■■■■■ 4.12
SYT12-205ENST00000527043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.76■■■■■ 4.11
SYT12-205ENST00000527043 GRIN2AQ12879 1464 aa40.68■■■■■ 4.1
SYT12-205ENST00000527043 CHD1O14646 1710 aa40.64■■■■■ 4.1
SYT12-205ENST00000527043 CEP162Q5TB80 1403 aa40.62■■■■■ 4.09
SYT12-205ENST00000527043 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
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