RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557850.5

RAD51-210, Transcript of RAD51 recombinase, humanhuman

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Gene RAD51, Length 1,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51-210ENST00000557850 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.28■■■■■ 7.4
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RAD51-210ENST00000557850 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.98■■■■■ 5.91
RAD51-210ENST00000557850 NACADO15069 1562 aa51.71■■■■■ 5.87
RAD51-210ENST00000557850 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.7■■■■■ 5.87
RAD51-210ENST00000557850 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.09■■■■■ 5.77
RAD51-210ENST00000557850 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.94■■■■■ 5.75
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RAD51-210ENST00000557850 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.77■■■■■ 5.72
RAD51-210ENST00000557850 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.58■■■■■ 5.69
RAD51-210ENST00000557850 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.5■■■■■ 5.67
RAD51-210ENST00000557850 SCRIBQ14160 1630 aa50■■■■■ 5.59
RAD51-210ENST00000557850 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.75■■■■■ 5.55
RAD51-210ENST00000557850 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.23■■■■■ 5.47
RAD51-210ENST00000557850 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
RAD51-210ENST00000557850 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.08■■■■■ 5.45
RAD51-210ENST00000557850 NCAPD3P42695 1498 aa47.78■■■■■ 5.24
RAD51-210ENST00000557850 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.71■■■■■ 5.23
RAD51-210ENST00000557850 SMARCA4P51532 1647 aa47.7■■■■■ 5.23
RAD51-210ENST00000557850 SMARCA2P51531 1590 aa47.52■■■■■ 5.2
RAD51-210ENST00000557850 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.51■■■■■ 5.2
RAD51-210ENST00000557850 HMGXB3Q12766 1538 aa47.4■■■■■ 5.18
RAD51-210ENST00000557850 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.26■■■■■ 5.16
RAD51-210ENST00000557850 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
RAD51-210ENST00000557850 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.2■■■■■ 5.15
RAD51-210ENST00000557850 ERCC6Q03468 1493 aa47.03■■■■■ 5.12
RAD51-210ENST00000557850 NESP48681 1621 aa46.97■■■■■ 5.11
RAD51-210ENST00000557850 CUX2O14529 1486 aa46.79■■■■■ 5.08
RAD51-210ENST00000557850 WIZO95785 1651 aa46.68■■■■■ 5.06
RAD51-210ENST00000557850 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.59■■■■■ 5.05
RAD51-210ENST00000557850 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.46■■■■■ 5.03
RAD51-210ENST00000557850 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.42■■■■■ 5.02
RAD51-210ENST00000557850 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.37■■■■■ 5.01
RAD51-210ENST00000557850 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.36■■■■■ 5.01
RAD51-210ENST00000557850 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
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RAD51-210ENST00000557850 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.94■■■■■ 4.95
RAD51-210ENST00000557850 CFTRP13569 1480 aa45.9■■■■■ 4.94
RAD51-210ENST00000557850 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.84■■■■■ 4.93
RAD51-210ENST00000557850 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.82■■■■■ 4.93
RAD51-210ENST00000557850 WDR62O43379 1518 aa45.79■■■■■ 4.92
RAD51-210ENST00000557850 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.63■■■■■ 4.9
RAD51-210ENST00000557850 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
RAD51-210ENST00000557850 PRDM2Q13029 1718 aa45.32■■■■■ 4.85
RAD51-210ENST00000557850 TOPBP1Q92547 1522 aa45■■■■■ 4.79
RAD51-210ENST00000557850 IFT140Q96RY7 1462 aa44.9■■■■■ 4.78
RAD51-210ENST00000557850 ABCC8Q09428 1581 aa44.87■■■■■ 4.77
RAD51-210ENST00000557850 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
RAD51-210ENST00000557850 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.83■■■■■ 4.77
RAD51-210ENST00000557850 OSCARQ8IYS5 282 aa44.8■■■■■ 4.76
RAD51-210ENST00000557850 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.71■■■■■ 4.75
RAD51-210ENST00000557850 TRIM41Q8WV44 630 aa44.61■■■■■ 4.73
RAD51-210ENST00000557850 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.57■■■■■ 4.72
RAD51-210ENST00000557850 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
RAD51-210ENST00000557850 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
RAD51-210ENST00000557850 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.5■■■■■ 4.713e-8■■■■■ 35
RAD51-210ENST00000557850 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.45■■■■■ 4.71
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RAD51-210ENST00000557850 CUX1P39880 1505 aa44.37■■■■■ 4.69
RAD51-210ENST00000557850 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.35■■■■■ 4.69
RAD51-210ENST00000557850 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
RAD51-210ENST00000557850 FBLN2P98095 1184 aa44.18■■■■■ 4.66
RAD51-210ENST00000557850 CHD1O14646 1710 aa44.12■■■■■ 4.65
RAD51-210ENST00000557850 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.11■■■■■ 4.65
RAD51-210ENST00000557850 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.11■■■■■ 4.65
RAD51-210ENST00000557850 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.11■■■■■ 4.65
RAD51-210ENST00000557850 WDR97A6NE52 1622 aa44.03■■■■■ 4.64
RAD51-210ENST00000557850 ARHGEF11O15085 1522 aa44.03■■■■■ 4.64
RAD51-210ENST00000557850 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.02■■■■■ 4.64
RAD51-210ENST00000557850 GRIN2BQ13224 1484 aa43.93■■■■■ 4.62
RAD51-210ENST00000557850 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.61
RAD51-210ENST00000557850 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
RAD51-210ENST00000557850 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.84■■■■■ 4.61
RAD51-210ENST00000557850 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.84■■■■■ 4.61
RAD51-210ENST00000557850 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.77■■■■■ 4.6
RAD51-210ENST00000557850 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.6
RAD51-210ENST00000557850 SYNJ2O15056 1496 aa43.75■■■■■ 4.59
RAD51-210ENST00000557850 PBRM1Q86U86 1689 aa43.71■■■■■ 4.59
RAD51-210ENST00000557850 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.71■■■■■ 4.59
RAD51-210ENST00000557850 TOP2BQ02880 1626 aa43.7■■■■■ 4.59
RAD51-210ENST00000557850 SYNJ1O43426 1573 aa43.7■■■■■ 4.59
RAD51-210ENST00000557850 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.68■■■■■ 4.58
RAD51-210ENST00000557850 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.66■■■■■ 4.58
RAD51-210ENST00000557850 ARAP1Q96P48 1450 aa43.64■■■■■ 4.58
RAD51-210ENST00000557850 GRIN2AQ12879 1464 aa43.37■■■■■ 4.53
RAD51-210ENST00000557850 ADAMTS12P58397 1594 aa43.37■■■■■ 4.53
RAD51-210ENST00000557850 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.3■■■■■ 4.52
RAD51-210ENST00000557850 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.27■■■■■ 4.52
RAD51-210ENST00000557850 NUP160Q12769 1436 aa43.22■■■■■ 4.51
RAD51-210ENST00000557850 CEP170Q5SW79 1584 aa43.21■■■■■ 4.51
RAD51-210ENST00000557850 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
RAD51-210ENST00000557850 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.07■■■■■ 4.49
RAD51-210ENST00000557850 SHROOM2Q13796 1616 aa42.93■■■■■ 4.46
RAD51-210ENST00000557850 KIF27Q86VH2 1401 aa42.9■■■■■ 4.46
RAD51-210ENST00000557850 IGF1RP08069 1367 aa42.9■■■■■ 4.46
RAD51-210ENST00000557850 JPH4Q96JJ6 628 aa42.84■■■■■ 4.45
RAD51-210ENST00000557850 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
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