Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZKSCAN3Q9BRR0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN3Q9BRR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN3Q9BRR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms