Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BBXQ8WY36 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BBXQ8WY36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BBXQ8WY36 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BBXQ8WY36 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBXQ8WY36 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms