RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.72■■■■■ 4.91
PITX1-201ENST00000265340 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.98■■■■□ 3.99
PITX1-201ENST00000265340 ABCC9O60706 1549 aa38.55■■■■□ 3.76
PITX1-201ENST00000265340 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
PITX1-201ENST00000265340 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.23■■■■□ 3.71
PITX1-201ENST00000265340 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.81■■■■□ 3.64
PITX1-201ENST00000265340 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.65■■■■□ 3.62
PITX1-201ENST00000265340 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.62
PITX1-201ENST00000265340 NACADO15069 1562 aa37.4■■■■□ 3.58
PITX1-201ENST00000265340 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.37■■■■□ 3.57
PITX1-201ENST00000265340 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.24■■■■□ 3.55
PITX1-201ENST00000265340 HRCP23327 699 aa36.98■■■■□ 3.51
PITX1-201ENST00000265340 SCRIBQ14160 1630 aa36.92■■■■□ 3.5
PITX1-201ENST00000265340 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
PITX1-201ENST00000265340 MYT1Q01538 1121 aa36.64■■■■□ 3.46
PITX1-201ENST00000265340 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.53■■■■□ 3.44
PITX1-201ENST00000265340 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.41
PITX1-201ENST00000265340 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.18■■■■□ 3.38
PITX1-201ENST00000265340 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
PITX1-201ENST00000265340 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.68■■■■□ 3.3
PITX1-201ENST00000265340 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PITX1-201ENST00000265340 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
PITX1-201ENST00000265340 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.39■■■■□ 3.26
PITX1-201ENST00000265340 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX1-201ENST00000265340 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.31■■■■□ 3.24
PITX1-201ENST00000265340 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PITX1-201ENST00000265340 SMARCA4P51532 1647 aa35.25■■■■□ 3.23
PITX1-201ENST00000265340 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
PITX1-201ENST00000265340 WIZO95785 1651 aa35.07■■■■□ 3.2
PITX1-201ENST00000265340 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.83■■■■□ 3.17
PITX1-201ENST00000265340 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
PITX1-201ENST00000265340 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.78■■■■□ 3.16
PITX1-201ENST00000265340 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.75■■■■□ 3.15
PITX1-201ENST00000265340 SMARCA2P51531 1590 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX1-201ENST00000265340 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PITX1-201ENST00000265340 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PITX1-201ENST00000265340 NCAPD3P42695 1498 aa34.55■■■■□ 3.12
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.54■■■■□ 3.12
PITX1-201ENST00000265340 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PITX1-201ENST00000265340 HMGXB3Q12766 1538 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX1-201ENST00000265340 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
PITX1-201ENST00000265340 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.3■■■■□ 3.08
PITX1-201ENST00000265340 TRIM41Q8WV44 630 aa34.25■■■■□ 3.07
PITX1-201ENST00000265340 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
PITX1-201ENST00000265340 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.15■■■■□ 3.06
PITX1-201ENST00000265340 NEUROD1Q13562 356 aa34.08■■■■□ 3.05
PITX1-201ENST00000265340 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.01■■■■□ 3.03
PITX1-201ENST00000265340 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
PITX1-201ENST00000265340 ABCC8Q09428 1581 aa33.82■■■■□ 3.01
PITX1-201ENST00000265340 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
PITX1-201ENST00000265340 BCL11AQ9H165 835 aa33.72■■■□□ 2.99
PITX1-201ENST00000265340 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.69■■■□□ 2.98
PITX1-201ENST00000265340 NESP48681 1621 aa33.69■■■□□ 2.98
PITX1-201ENST00000265340 CFTRP13569 1480 aa33.67■■■□□ 2.98
PITX1-201ENST00000265340 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.51■■■□□ 2.96
PITX1-201ENST00000265340 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.45■■■□□ 2.95
PITX1-201ENST00000265340 PRDM2Q13029 1718 aa33.39■■■□□ 2.94
PITX1-201ENST00000265340 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.93
PITX1-201ENST00000265340 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.35■■■□□ 2.93
PITX1-201ENST00000265340 SOGA1O94964 1423 aa33.32■■■□□ 2.92
PITX1-201ENST00000265340 SYNJ1O43426 1573 aa33.29■■■□□ 2.92
PITX1-201ENST00000265340 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
PITX1-201ENST00000265340 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.25■■■□□ 2.91
PITX1-201ENST00000265340 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.21■■■□□ 2.91
PITX1-201ENST00000265340 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.19■■■□□ 2.9
PITX1-201ENST00000265340 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.17■■■□□ 2.9
PITX1-201ENST00000265340 CUX1P39880 1505 aa33.09■■■□□ 2.89
PITX1-201ENST00000265340 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
PITX1-201ENST00000265340 ANP32EQ9BTT0 268 aa33.08■■■□□ 2.89
PITX1-201ENST00000265340 ERCC6Q03468 1493 aa33.06■■■□□ 2.88
PITX1-201ENST00000265340 EEA1Q15075 1411 aa33.05■■■□□ 2.88
PITX1-201ENST00000265340 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.02■■■□□ 2.88
PITX1-201ENST00000265340 TOP2BQ02880 1626 aa32.99■■■□□ 2.87
PITX1-201ENST00000265340 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
PITX1-201ENST00000265340 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.93■■■□□ 2.86
PITX1-201ENST00000265340 TOPBP1Q92547 1522 aa32.92■■■□□ 2.86
PITX1-201ENST00000265340 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.88■■■□□ 2.85
PITX1-201ENST00000265340 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.86■■■□□ 2.85
PITX1-201ENST00000265340 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.82■■■□□ 2.84
PITX1-201ENST00000265340 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.78■■■□□ 2.84
PITX1-201ENST00000265340 ERICH6Q7L0X2 663 aa32.76■■■□□ 2.83
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA3Q08378 1498 aa32.75■■■□□ 2.83
PITX1-201ENST00000265340 CEP162Q5TB80 1403 aa32.74■■■□□ 2.83
PITX1-201ENST00000265340 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
PITX1-201ENST00000265340 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
PITX1-201ENST00000265340 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
PITX1-201ENST00000265340 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.69■■■□□ 2.82
PITX1-201ENST00000265340 WDR62O43379 1518 aa32.68■■■□□ 2.82
PITX1-201ENST00000265340 KIF21BO75037 1637 aa32.67■■■□□ 2.82
PITX1-201ENST00000265340 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.56■■■□□ 2.8
PITX1-201ENST00000265340 CUX2O14529 1486 aa32.53■■■□□ 2.8
PITX1-201ENST00000265340 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.47■■■□□ 2.79
PITX1-201ENST00000265340 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.45■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 KIF27Q86VH2 1401 aa32.44■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.43■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 APLP2Q06481 763 aa32.42■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
PITX1-201ENST00000265340 PRXQ9BXM0 1461 aa32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms