Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C17orf47Q8NEP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf47Q8NEP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C17orf47Q8NEP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C17orf47Q8NEP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms