Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CTTNQ14247 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTTNQ14247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTTNQ14247 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTTNQ14247 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTTNQ14247 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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