Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP1S1P61966 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP1S1P61966 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AP1S1P61966 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AP1S1P61966 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AP1S1P61966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms