Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP11P51784 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP11P51784 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP11P51784 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP11P51784 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
USP11P51784 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP11P51784 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP11P51784 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP11P51784 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP11P51784 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP11P51784 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP11P51784 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP11P51784 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP11P51784 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP11P51784 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP11P51784 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP11P51784 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP11P51784 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP11P51784 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP11P51784 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP11P51784 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP11P51784 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP11P51784 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP11P51784 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP11P51784 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP11P51784 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP11P51784 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP11P51784 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP11P51784 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP11P51784 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP11P51784 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP11P51784 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP11P51784 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP11P51784 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP11P51784 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP11P51784 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP11P51784 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP11P51784 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP11P51784 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP11P51784 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP11P51784 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP11P51784 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP11P51784 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP11P51784 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP11P51784 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP11P51784 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP11P51784 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP11P51784 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP11P51784 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP11P51784 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP11P51784 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP11P51784 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP11P51784 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP11P51784 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP11P51784 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP11P51784 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP11P51784 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP11P51784 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP11P51784 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP11P51784 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP11P51784 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP11P51784 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP11P51784 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP11P51784 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP11P51784 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP11P51784 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP11P51784 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP11P51784 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP11P51784 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP11P51784 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP11P51784 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP11P51784 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP11P51784 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP11P51784 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP11P51784 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP11P51784 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP11P51784 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP11P51784 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP11P51784 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP11P51784 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP11P51784 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP11P51784 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP11P51784 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP11P51784 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP11P51784 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP11P51784 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP11P51784 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP11P51784 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP11P51784 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP11P51784 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP11P51784 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP11P51784 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP11P51784 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP11P51784 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms