Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDHAP00338 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDHAP00338 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LDHAP00338 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDHAP00338 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDHAP00338 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LDHAP00338 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDHAP00338 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDHAP00338 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDHAP00338 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LDHAP00338 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LDHAP00338 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LDHAP00338 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LDHAP00338 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDHAP00338 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDHAP00338 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDHAP00338 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDHAP00338 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LDHAP00338 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LDHAP00338 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHAP00338 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHAP00338 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHAP00338 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHAP00338 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHAP00338 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LDHAP00338 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHAP00338 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHAP00338 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHAP00338 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LDHAP00338 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHAP00338 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHAP00338 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LDHAP00338 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LDHAP00338 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LDHAP00338 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHAP00338 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHAP00338 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHAP00338 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHAP00338 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LDHAP00338 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHAP00338 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHAP00338 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHAP00338 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LDHAP00338 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHAP00338 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHAP00338 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHAP00338 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHAP00338 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LDHAP00338 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHAP00338 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHAP00338 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LDHAP00338 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHAP00338 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHAP00338 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LDHAP00338 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHAP00338 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHAP00338 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHAP00338 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHAP00338 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LDHAP00338 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHAP00338 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHAP00338 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LDHAP00338 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHAP00338 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHAP00338 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHAP00338 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LDHAP00338 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHAP00338 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHAP00338 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHAP00338 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHAP00338 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LDHAP00338 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHAP00338 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHAP00338 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHAP00338 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHAP00338 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHAP00338 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LDHAP00338 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHAP00338 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHAP00338 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHAP00338 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHAP00338 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHAP00338 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LDHAP00338 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHAP00338 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHAP00338 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHAP00338 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LDHAP00338 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LDHAP00338 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHAP00338 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHAP00338 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LDHAP00338 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LDHAP00338 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms