Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN7O95471 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN7O95471 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN7O95471 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN7O95471 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms