Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLDN7O95471 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLDN7O95471 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CLDN7O95471 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CLDN7O95471 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLDN7O95471 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLDN7O95471 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CLDN7O95471 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CLDN7O95471 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CLDN7O95471 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLDN7O95471 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLDN7O95471 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLDN7O95471 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLDN7O95471 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLDN7O95471 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLDN7O95471 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLDN7O95471 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLDN7O95471 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLDN7O95471 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLDN7O95471 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLDN7O95471 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLDN7O95471 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLDN7O95471 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLDN7O95471 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CLDN7O95471 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLDN7O95471 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLDN7O95471 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLDN7O95471 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLDN7O95471 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLDN7O95471 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CLDN7O95471 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CLDN7O95471 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CLDN7O95471 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLDN7O95471 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLDN7O95471 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLDN7O95471 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLDN7O95471 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLDN7O95471 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLDN7O95471 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLDN7O95471 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLDN7O95471 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLDN7O95471 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLDN7O95471 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLDN7O95471 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLDN7O95471 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLDN7O95471 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLDN7O95471 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLDN7O95471 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLDN7O95471 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN7O95471 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLDN7O95471 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLDN7O95471 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLDN7O95471 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLDN7O95471 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLDN7O95471 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLDN7O95471 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLDN7O95471 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLDN7O95471 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLDN7O95471 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLDN7O95471 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLDN7O95471 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLDN7O95471 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLDN7O95471 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLDN7O95471 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CLDN7O95471 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLDN7O95471 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLDN7O95471 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLDN7O95471 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLDN7O95471 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLDN7O95471 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLDN7O95471 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLDN7O95471 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLDN7O95471 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN7O95471 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CLDN7O95471 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLDN7O95471 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CLDN7O95471 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLDN7O95471 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLDN7O95471 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLDN7O95471 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN7O95471 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLDN7O95471 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLDN7O95471 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN7O95471 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLDN7O95471 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLDN7O95471 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN7O95471 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLDN7O95471 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLDN7O95471 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLDN7O95471 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLDN7O95471 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLDN7O95471 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLDN7O95471 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLDN7O95471 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN7O95471 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLDN7O95471 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLDN7O95471 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLDN7O95471 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLDN7O95471 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLDN7O95471 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms