Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKNO60260 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKNO60260 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKNO60260 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKNO60260 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKNO60260 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKNO60260 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKNO60260 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKNO60260 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKNO60260 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKNO60260 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKNO60260 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKNO60260 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKNO60260 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKNO60260 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKNO60260 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKNO60260 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKNO60260 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKNO60260 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKNO60260 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKNO60260 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKNO60260 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKNO60260 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKNO60260 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKNO60260 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKNO60260 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKNO60260 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKNO60260 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKNO60260 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKNO60260 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKNO60260 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKNO60260 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKNO60260 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKNO60260 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKNO60260 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKNO60260 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKNO60260 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKNO60260 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKNO60260 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKNO60260 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKNO60260 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKNO60260 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKNO60260 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKNO60260 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKNO60260 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKNO60260 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKNO60260 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKNO60260 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKNO60260 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKNO60260 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKNO60260 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKNO60260 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKNO60260 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKNO60260 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKNO60260 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKNO60260 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKNO60260 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKNO60260 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKNO60260 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKNO60260 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKNO60260 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKNO60260 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKNO60260 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKNO60260 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKNO60260 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKNO60260 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKNO60260 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKNO60260 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKNO60260 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKNO60260 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKNO60260 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKNO60260 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms