Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCF2Q9UG63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCF2Q9UG63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCF2Q9UG63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCF2Q9UG63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCF2Q9UG63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms