Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL20A1Q9P218 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COL20A1Q9P218 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL20A1Q9P218 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL20A1Q9P218 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL20A1Q9P218 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms