Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
R3HCC1Q9Y3T6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
R3HCC1Q9Y3T6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
R3HCC1Q9Y3T6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
R3HCC1Q9Y3T6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
R3HCC1Q9Y3T6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
R3HCC1Q9Y3T6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
R3HCC1Q9Y3T6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
R3HCC1Q9Y3T6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
R3HCC1Q9Y3T6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
R3HCC1Q9Y3T6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
R3HCC1Q9Y3T6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
R3HCC1Q9Y3T6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
R3HCC1Q9Y3T6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
R3HCC1Q9Y3T6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
R3HCC1Q9Y3T6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
R3HCC1Q9Y3T6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HCC1Q9Y3T6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
R3HCC1Q9Y3T6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
R3HCC1Q9Y3T6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
R3HCC1Q9Y3T6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
R3HCC1Q9Y3T6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
R3HCC1Q9Y3T6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
R3HCC1Q9Y3T6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
R3HCC1Q9Y3T6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
R3HCC1Q9Y3T6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
R3HCC1Q9Y3T6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
R3HCC1Q9Y3T6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
R3HCC1Q9Y3T6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
R3HCC1Q9Y3T6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
R3HCC1Q9Y3T6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
R3HCC1Q9Y3T6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
R3HCC1Q9Y3T6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
R3HCC1Q9Y3T6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
R3HCC1Q9Y3T6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
R3HCC1Q9Y3T6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
R3HCC1Q9Y3T6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
R3HCC1Q9Y3T6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
R3HCC1Q9Y3T6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
R3HCC1Q9Y3T6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
R3HCC1Q9Y3T6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
R3HCC1Q9Y3T6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
R3HCC1Q9Y3T6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
R3HCC1Q9Y3T6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
R3HCC1Q9Y3T6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
R3HCC1Q9Y3T6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
R3HCC1Q9Y3T6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
R3HCC1Q9Y3T6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
R3HCC1Q9Y3T6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
R3HCC1Q9Y3T6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
R3HCC1Q9Y3T6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
R3HCC1Q9Y3T6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
R3HCC1Q9Y3T6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
R3HCC1Q9Y3T6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
R3HCC1Q9Y3T6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
R3HCC1Q9Y3T6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
R3HCC1Q9Y3T6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
R3HCC1Q9Y3T6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
R3HCC1Q9Y3T6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
R3HCC1Q9Y3T6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
R3HCC1Q9Y3T6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
R3HCC1Q9Y3T6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
R3HCC1Q9Y3T6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
R3HCC1Q9Y3T6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
R3HCC1Q9Y3T6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
R3HCC1Q9Y3T6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
R3HCC1Q9Y3T6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
R3HCC1Q9Y3T6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
R3HCC1Q9Y3T6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
R3HCC1Q9Y3T6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HCC1Q9Y3T6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HCC1Q9Y3T6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HCC1Q9Y3T6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
R3HCC1Q9Y3T6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
R3HCC1Q9Y3T6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
R3HCC1Q9Y3T6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
R3HCC1Q9Y3T6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
R3HCC1Q9Y3T6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
R3HCC1Q9Y3T6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms