Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBQLN2Q9UHD9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UBQLN2Q9UHD9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBQLN2Q9UHD9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBQLN2Q9UHD9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBQLN2Q9UHD9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBQLN2Q9UHD9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBQLN2Q9UHD9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBQLN2Q9UHD9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBQLN2Q9UHD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBQLN2Q9UHD9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UBQLN2Q9UHD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBQLN2Q9UHD9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBQLN2Q9UHD9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBQLN2Q9UHD9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBQLN2Q9UHD9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBQLN2Q9UHD9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBQLN2Q9UHD9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBQLN2Q9UHD9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBQLN2Q9UHD9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBQLN2Q9UHD9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBQLN2Q9UHD9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBQLN2Q9UHD9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBQLN2Q9UHD9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBQLN2Q9UHD9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBQLN2Q9UHD9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBQLN2Q9UHD9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBQLN2Q9UHD9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBQLN2Q9UHD9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBQLN2Q9UHD9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBQLN2Q9UHD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBQLN2Q9UHD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBQLN2Q9UHD9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBQLN2Q9UHD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBQLN2Q9UHD9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBQLN2Q9UHD9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBQLN2Q9UHD9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBQLN2Q9UHD9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBQLN2Q9UHD9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBQLN2Q9UHD9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBQLN2Q9UHD9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBQLN2Q9UHD9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBQLN2Q9UHD9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBQLN2Q9UHD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBQLN2Q9UHD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBQLN2Q9UHD9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBQLN2Q9UHD9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBQLN2Q9UHD9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBQLN2Q9UHD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBQLN2Q9UHD9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBQLN2Q9UHD9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBQLN2Q9UHD9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBQLN2Q9UHD9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBQLN2Q9UHD9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBQLN2Q9UHD9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBQLN2Q9UHD9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBQLN2Q9UHD9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBQLN2Q9UHD9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBQLN2Q9UHD9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBQLN2Q9UHD9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBQLN2Q9UHD9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBQLN2Q9UHD9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBQLN2Q9UHD9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBQLN2Q9UHD9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBQLN2Q9UHD9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBQLN2Q9UHD9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBQLN2Q9UHD9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBQLN2Q9UHD9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBQLN2Q9UHD9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBQLN2Q9UHD9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBQLN2Q9UHD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBQLN2Q9UHD9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBQLN2Q9UHD9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBQLN2Q9UHD9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBQLN2Q9UHD9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBQLN2Q9UHD9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBQLN2Q9UHD9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBQLN2Q9UHD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBQLN2Q9UHD9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms