Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COPZ2Q9P299 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COPZ2Q9P299 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COPZ2Q9P299 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COPZ2Q9P299 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COPZ2Q9P299 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COPZ2Q9P299 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COPZ2Q9P299 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COPZ2Q9P299 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COPZ2Q9P299 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPZ2Q9P299 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPZ2Q9P299 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPZ2Q9P299 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COPZ2Q9P299 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPZ2Q9P299 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPZ2Q9P299 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPZ2Q9P299 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COPZ2Q9P299 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COPZ2Q9P299 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPZ2Q9P299 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPZ2Q9P299 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPZ2Q9P299 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPZ2Q9P299 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COPZ2Q9P299 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPZ2Q9P299 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPZ2Q9P299 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPZ2Q9P299 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COPZ2Q9P299 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPZ2Q9P299 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPZ2Q9P299 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPZ2Q9P299 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPZ2Q9P299 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPZ2Q9P299 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPZ2Q9P299 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COPZ2Q9P299 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COPZ2Q9P299 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPZ2Q9P299 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPZ2Q9P299 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPZ2Q9P299 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPZ2Q9P299 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COPZ2Q9P299 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPZ2Q9P299 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPZ2Q9P299 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPZ2Q9P299 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COPZ2Q9P299 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPZ2Q9P299 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPZ2Q9P299 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COPZ2Q9P299 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPZ2Q9P299 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPZ2Q9P299 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COPZ2Q9P299 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COPZ2Q9P299 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COPZ2Q9P299 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ2Q9P299 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ2Q9P299 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPZ2Q9P299 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPZ2Q9P299 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPZ2Q9P299 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPZ2Q9P299 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPZ2Q9P299 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPZ2Q9P299 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPZ2Q9P299 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPZ2Q9P299 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPZ2Q9P299 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPZ2Q9P299 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPZ2Q9P299 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPZ2Q9P299 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPZ2Q9P299 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPZ2Q9P299 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPZ2Q9P299 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPZ2Q9P299 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPZ2Q9P299 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPZ2Q9P299 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPZ2Q9P299 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPZ2Q9P299 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPZ2Q9P299 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPZ2Q9P299 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPZ2Q9P299 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPZ2Q9P299 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPZ2Q9P299 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPZ2Q9P299 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPZ2Q9P299 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPZ2Q9P299 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPZ2Q9P299 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPZ2Q9P299 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPZ2Q9P299 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPZ2Q9P299 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPZ2Q9P299 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPZ2Q9P299 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPZ2Q9P299 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPZ2Q9P299 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPZ2Q9P299 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPZ2Q9P299 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPZ2Q9P299 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COPZ2Q9P299 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPZ2Q9P299 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPZ2Q9P299 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPZ2Q9P299 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPZ2Q9P299 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPZ2Q9P299 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms