Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY87

SPANXC, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXCQ9NY87 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPANXCQ9NY87 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXCQ9NY87 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPANXCQ9NY87 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPANXCQ9NY87 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPANXCQ9NY87 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPANXCQ9NY87 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPANXCQ9NY87 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPANXCQ9NY87 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPANXCQ9NY87 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPANXCQ9NY87 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXCQ9NY87 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXCQ9NY87 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXCQ9NY87 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPANXCQ9NY87 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPANXCQ9NY87 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPANXCQ9NY87 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXCQ9NY87 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPANXCQ9NY87 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXCQ9NY87 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPANXCQ9NY87 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPANXCQ9NY87 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPANXCQ9NY87 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPANXCQ9NY87 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPANXCQ9NY87 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPANXCQ9NY87 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPANXCQ9NY87 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPANXCQ9NY87 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPANXCQ9NY87 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPANXCQ9NY87 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPANXCQ9NY87 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPANXCQ9NY87 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPANXCQ9NY87 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPANXCQ9NY87 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPANXCQ9NY87 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPANXCQ9NY87 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPANXCQ9NY87 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPANXCQ9NY87 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPANXCQ9NY87 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPANXCQ9NY87 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPANXCQ9NY87 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPANXCQ9NY87 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPANXCQ9NY87 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPANXCQ9NY87 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPANXCQ9NY87 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPANXCQ9NY87 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPANXCQ9NY87 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPANXCQ9NY87 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPANXCQ9NY87 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPANXCQ9NY87 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPANXCQ9NY87 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPANXCQ9NY87 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXCQ9NY87 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXCQ9NY87 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPANXCQ9NY87 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXCQ9NY87 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXCQ9NY87 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXCQ9NY87 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXCQ9NY87 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPANXCQ9NY87 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPANXCQ9NY87 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPANXCQ9NY87 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPANXCQ9NY87 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPANXCQ9NY87 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPANXCQ9NY87 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPANXCQ9NY87 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPANXCQ9NY87 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPANXCQ9NY87 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPANXCQ9NY87 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPANXCQ9NY87 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SPANXCQ9NY87 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SPANXCQ9NY87 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPANXCQ9NY87 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SPANXCQ9NY87 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SPANXCQ9NY87 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SPANXCQ9NY87 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPANXCQ9NY87 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPANXCQ9NY87 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPANXCQ9NY87 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms