Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MS4A3Q96HJ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MS4A3Q96HJ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MS4A3Q96HJ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MS4A3Q96HJ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MS4A3Q96HJ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MS4A3Q96HJ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MS4A3Q96HJ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A3Q96HJ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A3Q96HJ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MS4A3Q96HJ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MS4A3Q96HJ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A3Q96HJ5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MS4A3Q96HJ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MS4A3Q96HJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MS4A3Q96HJ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MS4A3Q96HJ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A3Q96HJ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A3Q96HJ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MS4A3Q96HJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MS4A3Q96HJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A3Q96HJ5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A3Q96HJ5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A3Q96HJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A3Q96HJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MS4A3Q96HJ5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MS4A3Q96HJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MS4A3Q96HJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MS4A3Q96HJ5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A3Q96HJ5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A3Q96HJ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A3Q96HJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MS4A3Q96HJ5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MS4A3Q96HJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MS4A3Q96HJ5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A3Q96HJ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MS4A3Q96HJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MS4A3Q96HJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A3Q96HJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MS4A3Q96HJ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MS4A3Q96HJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A3Q96HJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MS4A3Q96HJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MS4A3Q96HJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A3Q96HJ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A3Q96HJ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MS4A3Q96HJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MS4A3Q96HJ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MS4A3Q96HJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MS4A3Q96HJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A3Q96HJ5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A3Q96HJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A3Q96HJ5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A3Q96HJ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A3Q96HJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A3Q96HJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MS4A3Q96HJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A3Q96HJ5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MS4A3Q96HJ5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MS4A3Q96HJ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MS4A3Q96HJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MS4A3Q96HJ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A3Q96HJ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MS4A3Q96HJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MS4A3Q96HJ5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MS4A3Q96HJ5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MS4A3Q96HJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A3Q96HJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A3Q96HJ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A3Q96HJ5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A3Q96HJ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MS4A3Q96HJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MS4A3Q96HJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MS4A3Q96HJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MS4A3Q96HJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MS4A3Q96HJ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A3Q96HJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MS4A3Q96HJ5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A3Q96HJ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A3Q96HJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A3Q96HJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A3Q96HJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A3Q96HJ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A3Q96HJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A3Q96HJ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MS4A3Q96HJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MS4A3Q96HJ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A3Q96HJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A3Q96HJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A3Q96HJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A3Q96HJ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A3Q96HJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A3Q96HJ5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms