Protein–RNA interactions for Protein: Q63HQ0

AP1AR, AP-1 complex-associated regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1ARQ63HQ0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
AP1ARQ63HQ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
AP1ARQ63HQ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AP1ARQ63HQ0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
AP1ARQ63HQ0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
AP1ARQ63HQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AP1ARQ63HQ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
AP1ARQ63HQ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
AP1ARQ63HQ0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
AP1ARQ63HQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
AP1ARQ63HQ0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AP1ARQ63HQ0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
AP1ARQ63HQ0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
AP1ARQ63HQ0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
AP1ARQ63HQ0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
AP1ARQ63HQ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
AP1ARQ63HQ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
AP1ARQ63HQ0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
AP1ARQ63HQ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AP1ARQ63HQ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
AP1ARQ63HQ0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
AP1ARQ63HQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
AP1ARQ63HQ0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
AP1ARQ63HQ0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
AP1ARQ63HQ0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
AP1ARQ63HQ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
AP1ARQ63HQ0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AP1ARQ63HQ0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AP1ARQ63HQ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AP1ARQ63HQ0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
AP1ARQ63HQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP1ARQ63HQ0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AP1ARQ63HQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP1ARQ63HQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AP1ARQ63HQ0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AP1ARQ63HQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
AP1ARQ63HQ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AP1ARQ63HQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP1ARQ63HQ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP1ARQ63HQ0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP1ARQ63HQ0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP1ARQ63HQ0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP1ARQ63HQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AP1ARQ63HQ0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP1ARQ63HQ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AP1ARQ63HQ0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP1ARQ63HQ0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP1ARQ63HQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP1ARQ63HQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP1ARQ63HQ0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP1ARQ63HQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
AP1ARQ63HQ0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AP1ARQ63HQ0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP1ARQ63HQ0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
AP1ARQ63HQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AP1ARQ63HQ0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP1ARQ63HQ0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP1ARQ63HQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP1ARQ63HQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP1ARQ63HQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP1ARQ63HQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AP1ARQ63HQ0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP1ARQ63HQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP1ARQ63HQ0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AP1ARQ63HQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP1ARQ63HQ0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AP1ARQ63HQ0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
AP1ARQ63HQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AP1ARQ63HQ0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1ARQ63HQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP1ARQ63HQ0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AP1ARQ63HQ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1ARQ63HQ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AP1ARQ63HQ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP1ARQ63HQ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1ARQ63HQ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AP1ARQ63HQ0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1ARQ63HQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP1ARQ63HQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP1ARQ63HQ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP1ARQ63HQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP1ARQ63HQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP1ARQ63HQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP1ARQ63HQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AP1ARQ63HQ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP1ARQ63HQ0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP1ARQ63HQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP1ARQ63HQ0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP1ARQ63HQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP1ARQ63HQ0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP1ARQ63HQ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP1ARQ63HQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP1ARQ63HQ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP1ARQ63HQ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP1ARQ63HQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AP1ARQ63HQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP1ARQ63HQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP1ARQ63HQ0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP1ARQ63HQ0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP1ARQ63HQ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms