Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LIN52Q52LA3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LIN52Q52LA3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LIN52Q52LA3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LIN52Q52LA3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LIN52Q52LA3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LIN52Q52LA3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LIN52Q52LA3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LIN52Q52LA3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LIN52Q52LA3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
LIN52Q52LA3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LIN52Q52LA3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LIN52Q52LA3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LIN52Q52LA3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LIN52Q52LA3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
LIN52Q52LA3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LIN52Q52LA3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LIN52Q52LA3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LIN52Q52LA3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LIN52Q52LA3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LIN52Q52LA3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LIN52Q52LA3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LIN52Q52LA3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LIN52Q52LA3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LIN52Q52LA3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LIN52Q52LA3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LIN52Q52LA3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LIN52Q52LA3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LIN52Q52LA3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LIN52Q52LA3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LIN52Q52LA3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
LIN52Q52LA3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LIN52Q52LA3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIN52Q52LA3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LIN52Q52LA3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LIN52Q52LA3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LIN52Q52LA3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LIN52Q52LA3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LIN52Q52LA3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LIN52Q52LA3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LIN52Q52LA3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LIN52Q52LA3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LIN52Q52LA3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIN52Q52LA3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LIN52Q52LA3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LIN52Q52LA3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN52Q52LA3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LIN52Q52LA3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN52Q52LA3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LIN52Q52LA3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LIN52Q52LA3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LIN52Q52LA3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIN52Q52LA3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIN52Q52LA3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIN52Q52LA3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIN52Q52LA3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIN52Q52LA3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN52Q52LA3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIN52Q52LA3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIN52Q52LA3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIN52Q52LA3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIN52Q52LA3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIN52Q52LA3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIN52Q52LA3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIN52Q52LA3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIN52Q52LA3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIN52Q52LA3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIN52Q52LA3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIN52Q52LA3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN52Q52LA3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LIN52Q52LA3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN52Q52LA3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LIN52Q52LA3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LIN52Q52LA3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LIN52Q52LA3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LIN52Q52LA3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LIN52Q52LA3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LIN52Q52LA3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LIN52Q52LA3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LIN52Q52LA3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LIN52Q52LA3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LIN52Q52LA3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LIN52Q52LA3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LIN52Q52LA3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LIN52Q52LA3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LIN52Q52LA3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LIN52Q52LA3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LIN52Q52LA3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LIN52Q52LA3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LIN52Q52LA3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LIN52Q52LA3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIN52Q52LA3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIN52Q52LA3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIN52Q52LA3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LIN52Q52LA3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIN52Q52LA3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LIN52Q52LA3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN52Q52LA3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIN52Q52LA3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN52Q52LA3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms