Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TPRNQ4KMQ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TPRNQ4KMQ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TPRNQ4KMQ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TPRNQ4KMQ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TPRNQ4KMQ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TPRNQ4KMQ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TPRNQ4KMQ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TPRNQ4KMQ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TPRNQ4KMQ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TPRNQ4KMQ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TPRNQ4KMQ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TPRNQ4KMQ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TPRNQ4KMQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TPRNQ4KMQ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TPRNQ4KMQ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TPRNQ4KMQ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TPRNQ4KMQ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TPRNQ4KMQ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TPRNQ4KMQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TPRNQ4KMQ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TPRNQ4KMQ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TPRNQ4KMQ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TPRNQ4KMQ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TPRNQ4KMQ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TPRNQ4KMQ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TPRNQ4KMQ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TPRNQ4KMQ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TPRNQ4KMQ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TPRNQ4KMQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TPRNQ4KMQ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TPRNQ4KMQ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TPRNQ4KMQ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TPRNQ4KMQ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TPRNQ4KMQ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TPRNQ4KMQ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TPRNQ4KMQ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TPRNQ4KMQ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TPRNQ4KMQ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TPRNQ4KMQ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TPRNQ4KMQ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TPRNQ4KMQ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
TPRNQ4KMQ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TPRNQ4KMQ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TPRNQ4KMQ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TPRNQ4KMQ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
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