RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDSP2-202ENST00000547169 SCRIBQ14160 1630 aa30.27■■■□□ 2.44
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CTDSP2-202ENST00000547169 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.19■■■□□ 2.26
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CTDSP2-202ENST00000547169 SMARCA2P51531 1590 aa28.77■■■□□ 2.2
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CTDSP2-202ENST00000547169 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.78■■■□□ 2.04
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CTDSP2-202ENST00000547169 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.62■■■□□ 2.01
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CTDSP2-202ENST00000547169 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.53■■■□□ 2
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CTDSP2-202ENST00000547169 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.53■■□□□ 1.84
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CTDSP2-202ENST00000547169 OSCARQ8IYS5 282 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF27Q86VH2 1401 aa26.42■■□□□ 1.82
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CTDSP2-202ENST00000547169 EEA1Q15075 1411 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDSP2-202ENST00000547169 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDSP2-202ENST00000547169 CEP170Q5SW79 1584 aa26.03■■□□□ 1.76
CTDSP2-202ENST00000547169 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.01■■□□□ 1.75
CTDSP2-202ENST00000547169 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CTDSP2-202ENST00000547169 PRXQ9BXM0 1461 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDSP2-202ENST00000547169 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDSP2-202ENST00000547169 JPH4Q96JJ6 628 aa25.9■■□□□ 1.74
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