RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 MYT1Q01538 1121 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRC-209ENST00000442510 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRC-209ENST00000442510 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-209ENST00000442510 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRC-209ENST00000442510 SLC24A1O60721 1099 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRC-209ENST00000442510 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-209ENST00000442510 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRC-209ENST00000442510 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRC-209ENST00000442510 BCL11AQ9H165 835 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRC-209ENST00000442510 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRC-209ENST00000442510 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRC-209ENST00000442510 HRCP23327 699 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRC-209ENST00000442510 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-209ENST00000442510 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PTPRC-209ENST00000442510 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-209ENST00000442510 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRC-209ENST00000442510 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRC-209ENST00000442510 APLP2Q06481 763 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRC-209ENST00000442510 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRC-209ENST00000442510 NEFLP07196 543 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-209ENST00000442510 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-209ENST00000442510 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRC-209ENST00000442510 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-209ENST00000442510 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-209ENST00000442510 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-209ENST00000442510 NEUROD1Q13562 356 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 PDE4CQ08493 712 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHG5O94827 1062 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC136Q96JN2 1154 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRC-209ENST00000442510 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 HOMEZQ8IX15 550 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 ARXQ96QS3 562 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRC-209ENST00000442510 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 C14orf37Q86TY3 774 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 BCANQ96GW7 911 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 NBR1Q14596 966 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRC-209ENST00000442510 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-209ENST00000442510 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRC-209ENST00000442510 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-209ENST00000442510 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-209ENST00000442510 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-209ENST00000442510 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL34Q8N239 644 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 PTMSP20962 102 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 NEFMP07197 916 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 APPP05067 770 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP8Q14318 412 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-209ENST00000442510 ZMYND15Q9H091 742 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-209ENST00000442510 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 FGD1P98174 961 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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