RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367993.7

NDUFS2-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS2, Length 2,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS2-201ENST00000367993 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.94■■■■□ 3.5
NDUFS2-201ENST00000367993 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.37■■■□□ 2.77
NDUFS2-201ENST00000367993 ABCC9O60706 1549 aa31.31■■■□□ 2.6
NDUFS2-201ENST00000367993 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
NDUFS2-201ENST00000367993 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.83■■■□□ 2.53
NDUFS2-201ENST00000367993 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.38■■■□□ 2.45
NDUFS2-201ENST00000367993 NACADO15069 1562 aa30.24■■■□□ 2.43
NDUFS2-201ENST00000367993 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.17■■■□□ 2.42
NDUFS2-201ENST00000367993 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.15■■■□□ 2.42
NDUFS2-201ENST00000367993 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.01■■■□□ 2.39
NDUFS2-201ENST00000367993 SCRIBQ14160 1630 aa29.91■■■□□ 2.38
NDUFS2-201ENST00000367993 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.78■■■□□ 2.36
NDUFS2-201ENST00000367993 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.316e-6■■■■□ 21.1
NDUFS2-201ENST00000367993 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.42■■■□□ 2.3
NDUFS2-201ENST00000367993 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.9■■■□□ 2.22
NDUFS2-201ENST00000367993 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.62■■■□□ 2.17
NDUFS2-201ENST00000367993 SMARCA4P51532 1647 aa28.54■■■□□ 2.16
NDUFS2-201ENST00000367993 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
NDUFS2-201ENST00000367993 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
NDUFS2-201ENST00000367993 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
NDUFS2-201ENST00000367993 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
NDUFS2-201ENST00000367993 WIZO95785 1651 aa28.41■■■□□ 2.14
NDUFS2-201ENST00000367993 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.27■■■□□ 2.12
NDUFS2-201ENST00000367993 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.21■■■□□ 2.11
NDUFS2-201ENST00000367993 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.18■■■□□ 2.1
NDUFS2-201ENST00000367993 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.12■■■□□ 2.09
NDUFS2-201ENST00000367993 SMARCA2P51531 1590 aa28.05■■■□□ 2.08
NDUFS2-201ENST00000367993 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
NDUFS2-201ENST00000367993 NCAPD3P42695 1498 aa27.95■■■□□ 2.06
NDUFS2-201ENST00000367993 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
NDUFS2-201ENST00000367993 HMGXB3Q12766 1538 aa27.86■■■□□ 2.05
NDUFS2-201ENST00000367993 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.71■■■□□ 2.03
NDUFS2-201ENST00000367993 NESP48681 1621 aa27.37■■□□□ 1.97
NDUFS2-201ENST00000367993 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.22■■□□□ 1.95
NDUFS2-201ENST00000367993 CFTRP13569 1480 aa27.22■■□□□ 1.95
NDUFS2-201ENST00000367993 ABCC8Q09428 1581 aa27.09■■□□□ 1.93
NDUFS2-201ENST00000367993 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.09■■□□□ 1.93
NDUFS2-201ENST00000367993 PRDM2Q13029 1718 aa27.09■■□□□ 1.93
NDUFS2-201ENST00000367993 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.01■■□□□ 1.91
NDUFS2-201ENST00000367993 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.97■■□□□ 1.91
NDUFS2-201ENST00000367993 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.95■■□□□ 1.91
NDUFS2-201ENST00000367993 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.86■■□□□ 1.89
NDUFS2-201ENST00000367993 SYNJ1O43426 1573 aa26.83■■□□□ 1.88
NDUFS2-201ENST00000367993 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.82■■□□□ 1.88
NDUFS2-201ENST00000367993 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
NDUFS2-201ENST00000367993 CUX1P39880 1505 aa26.78■■□□□ 1.88
NDUFS2-201ENST00000367993 ERCC6Q03468 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
NDUFS2-201ENST00000367993 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NDUFS2-201ENST00000367993 TRIM41Q8WV44 630 aa26.72■■□□□ 1.87
NDUFS2-201ENST00000367993 TOP2BQ02880 1626 aa26.64■■□□□ 1.85
NDUFS2-201ENST00000367993 TOPBP1Q92547 1522 aa26.64■■□□□ 1.85
NDUFS2-201ENST00000367993 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
NDUFS2-201ENST00000367993 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.62■■□□□ 1.85
NDUFS2-201ENST00000367993 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.6■■□□□ 1.85
NDUFS2-201ENST00000367993 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.6■■□□□ 1.85
NDUFS2-201ENST00000367993 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.54■■□□□ 1.84
NDUFS2-201ENST00000367993 WDR62O43379 1518 aa26.5■■□□□ 1.83
NDUFS2-201ENST00000367993 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
NDUFS2-201ENST00000367993 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.48■■□□□ 1.83
NDUFS2-201ENST00000367993 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.43■■□□□ 1.82
NDUFS2-201ENST00000367993 SOGA1O94964 1423 aa26.42■■□□□ 1.82
NDUFS2-201ENST00000367993 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
NDUFS2-201ENST00000367993 CUX2O14529 1486 aa26.4■■□□□ 1.82
NDUFS2-201ENST00000367993 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
NDUFS2-201ENST00000367993 WDR97A6NE52 1622 aa26.27■■□□□ 1.8
NDUFS2-201ENST00000367993 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
NDUFS2-201ENST00000367993 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
NDUFS2-201ENST00000367993 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.21■■□□□ 1.79
NDUFS2-201ENST00000367993 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.2■■□□□ 1.78
NDUFS2-201ENST00000367993 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.783e-7■■■■■ 40.4
NDUFS2-201ENST00000367993 IFT140Q96RY7 1462 aa26.16■■□□□ 1.78
NDUFS2-201ENST00000367993 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.1■■□□□ 1.77
NDUFS2-201ENST00000367993 KIF27Q86VH2 1401 aa26.09■■□□□ 1.77
NDUFS2-201ENST00000367993 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
NDUFS2-201ENST00000367993 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
NDUFS2-201ENST00000367993 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.04■■□□□ 1.76
NDUFS2-201ENST00000367993 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.02■■□□□ 1.76
NDUFS2-201ENST00000367993 PBRM1Q86U86 1689 aa26.01■■□□□ 1.75
NDUFS2-201ENST00000367993 IGF1RP08069 1367 aa26■■□□□ 1.75
NDUFS2-201ENST00000367993 EEA1Q15075 1411 aa25.94■■□□□ 1.74
NDUFS2-201ENST00000367993 GRIN2BQ13224 1484 aa25.87■■□□□ 1.73
NDUFS2-201ENST00000367993 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.87■■□□□ 1.73
NDUFS2-201ENST00000367993 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.87■■□□□ 1.73
NDUFS2-201ENST00000367993 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.86■■□□□ 1.73
NDUFS2-201ENST00000367993 PRXQ9BXM0 1461 aa25.84■■□□□ 1.73
NDUFS2-201ENST00000367993 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.83■■□□□ 1.73
NDUFS2-201ENST00000367993 ADAMTS12P58397 1594 aa25.8■■□□□ 1.72
NDUFS2-201ENST00000367993 KIF21BO75037 1637 aa25.78■■□□□ 1.72
NDUFS2-201ENST00000367993 CUL7Q14999 1698 aa25.77■■□□□ 1.72
NDUFS2-201ENST00000367993 FBLN2P98095 1184 aa25.73■■□□□ 1.71
NDUFS2-201ENST00000367993 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
NDUFS2-201ENST00000367993 GOLGA3Q08378 1498 aa25.69■■□□□ 1.7
NDUFS2-201ENST00000367993 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
NDUFS2-201ENST00000367993 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
NDUFS2-201ENST00000367993 CHD1O14646 1710 aa25.67■■□□□ 1.7
NDUFS2-201ENST00000367993 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
NDUFS2-201ENST00000367993 SYNJ2O15056 1496 aa25.63■■□□□ 1.69
NDUFS2-201ENST00000367993 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
NDUFS2-201ENST00000367993 GRIN2AQ12879 1464 aa25.61■■□□□ 1.69
NDUFS2-201ENST00000367993 CEP170Q5SW79 1584 aa25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms