Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRCDQ00LT1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRCDQ00LT1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRCDQ00LT1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRCDQ00LT1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRCDQ00LT1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRCDQ00LT1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRCDQ00LT1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRCDQ00LT1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRCDQ00LT1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRCDQ00LT1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRCDQ00LT1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRCDQ00LT1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRCDQ00LT1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRCDQ00LT1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRCDQ00LT1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRCDQ00LT1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRCDQ00LT1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRCDQ00LT1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRCDQ00LT1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRCDQ00LT1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRCDQ00LT1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRCDQ00LT1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRCDQ00LT1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRCDQ00LT1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRCDQ00LT1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRCDQ00LT1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRCDQ00LT1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRCDQ00LT1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRCDQ00LT1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRCDQ00LT1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRCDQ00LT1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms