Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
NCALDP61601 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCALDP61601 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NCALDP61601 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCALDP61601 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCALDP61601 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCALDP61601 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NCALDP61601 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCALDP61601 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCALDP61601 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCALDP61601 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCALDP61601 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCALDP61601 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCALDP61601 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCALDP61601 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NCALDP61601 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NCALDP61601 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NCALDP61601 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NCALDP61601 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NCALDP61601 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NCALDP61601 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NCALDP61601 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NCALDP61601 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NCALDP61601 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCALDP61601 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NCALDP61601 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NCALDP61601 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NCALDP61601 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NCALDP61601 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NCALDP61601 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NCALDP61601 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NCALDP61601 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NCALDP61601 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NCALDP61601 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NCALDP61601 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NCALDP61601 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NCALDP61601 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NCALDP61601 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NCALDP61601 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCALDP61601 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NCALDP61601 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NCALDP61601 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NCALDP61601 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NCALDP61601 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NCALDP61601 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NCALDP61601 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NCALDP61601 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCALDP61601 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NCALDP61601 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCALDP61601 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCALDP61601 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCALDP61601 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCALDP61601 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCALDP61601 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCALDP61601 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCALDP61601 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCALDP61601 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCALDP61601 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCALDP61601 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCALDP61601 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCALDP61601 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCALDP61601 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCALDP61601 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCALDP61601 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCALDP61601 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCALDP61601 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCALDP61601 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCALDP61601 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCALDP61601 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCALDP61601 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCALDP61601 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCALDP61601 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCALDP61601 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCALDP61601 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCALDP61601 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCALDP61601 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCALDP61601 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCALDP61601 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCALDP61601 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCALDP61601 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCALDP61601 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCALDP61601 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCALDP61601 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCALDP61601 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCALDP61601 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCALDP61601 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCALDP61601 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCALDP61601 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCALDP61601 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCALDP61601 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCALDP61601 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NCALDP61601 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCALDP61601 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCALDP61601 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCALDP61601 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCALDP61601 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCALDP61601 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCALDP61601 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCALDP61601 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCALDP61601 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms