Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
LMAN1P49257 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LMAN1P49257 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMAN1P49257 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMAN1P49257 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMAN1P49257 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LMAN1P49257 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMAN1P49257 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LMAN1P49257 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
LMAN1P49257 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMAN1P49257 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMAN1P49257 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMAN1P49257 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMAN1P49257 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
LMAN1P49257 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMAN1P49257 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMAN1P49257 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMAN1P49257 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMAN1P49257 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMAN1P49257 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMAN1P49257 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMAN1P49257 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMAN1P49257 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMAN1P49257 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMAN1P49257 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMAN1P49257 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
LMAN1P49257 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMAN1P49257 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMAN1P49257 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMAN1P49257 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMAN1P49257 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
LMAN1P49257 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LMAN1P49257 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMAN1P49257 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
LMAN1P49257 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LMAN1P49257 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
LMAN1P49257 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LMAN1P49257 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LMAN1P49257 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LMAN1P49257 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMAN1P49257 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMAN1P49257 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMAN1P49257 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMAN1P49257 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMAN1P49257 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMAN1P49257 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LMAN1P49257 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMAN1P49257 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMAN1P49257 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LMAN1P49257 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMAN1P49257 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMAN1P49257 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
LMAN1P49257 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
LMAN1P49257 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMAN1P49257 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMAN1P49257 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMAN1P49257 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMAN1P49257 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMAN1P49257 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMAN1P49257 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMAN1P49257 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMAN1P49257 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMAN1P49257 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMAN1P49257 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMAN1P49257 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMAN1P49257 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMAN1P49257 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMAN1P49257 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMAN1P49257 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMAN1P49257 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMAN1P49257 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMAN1P49257 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMAN1P49257 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMAN1P49257 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LMAN1P49257 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LMAN1P49257 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMAN1P49257 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMAN1P49257 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LMAN1P49257 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMAN1P49257 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMAN1P49257 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMAN1P49257 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LMAN1P49257 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMAN1P49257 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMAN1P49257 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMAN1P49257 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMAN1P49257 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMAN1P49257 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms