Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PAX7P23759 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PAX7P23759 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PAX7P23759 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PAX7P23759 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PAX7P23759 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PAX7P23759 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PAX7P23759 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PAX7P23759 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PAX7P23759 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PAX7P23759 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PAX7P23759 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PAX7P23759 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAX7P23759 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PAX7P23759 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PAX7P23759 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PAX7P23759 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PAX7P23759 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PAX7P23759 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAX7P23759 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAX7P23759 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAX7P23759 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAX7P23759 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAX7P23759 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAX7P23759 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAX7P23759 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAX7P23759 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAX7P23759 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PAX7P23759 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PAX7P23759 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAX7P23759 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAX7P23759 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAX7P23759 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PAX7P23759 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PAX7P23759 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAX7P23759 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAX7P23759 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PAX7P23759 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAX7P23759 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAX7P23759 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAX7P23759 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAX7P23759 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAX7P23759 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAX7P23759 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAX7P23759 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAX7P23759 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAX7P23759 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PAX7P23759 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAX7P23759 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAX7P23759 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX7P23759 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAX7P23759 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAX7P23759 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAX7P23759 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAX7P23759 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAX7P23759 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAX7P23759 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAX7P23759 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAX7P23759 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PAX7P23759 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PAX7P23759 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX7P23759 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PAX7P23759 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PAX7P23759 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PAX7P23759 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PAX7P23759 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAX7P23759 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PAX7P23759 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PAX7P23759 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAX7P23759 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PAX7P23759 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAX7P23759 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAX7P23759 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PAX7P23759 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAX7P23759 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAX7P23759 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAX7P23759 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAX7P23759 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAX7P23759 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAX7P23759 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAX7P23759 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAX7P23759 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAX7P23759 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAX7P23759 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAX7P23759 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAX7P23759 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX7P23759 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAX7P23759 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAX7P23759 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAX7P23759 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAX7P23759 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAX7P23759 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAX7P23759 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAX7P23759 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAX7P23759 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAX7P23759 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAX7P23759 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PAX7P23759 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PAX7P23759 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PAX7P23759 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms