Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCNKO75909 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCNKO75909 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCNKO75909 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNKO75909 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNKO75909 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNKO75909 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCNKO75909 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCNKO75909 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCNKO75909 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNKO75909 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNKO75909 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNKO75909 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNKO75909 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNKO75909 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNKO75909 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNKO75909 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNKO75909 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNKO75909 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNKO75909 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNKO75909 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNKO75909 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNKO75909 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNKO75909 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNKO75909 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNKO75909 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCNKO75909 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNKO75909 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCNKO75909 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCNKO75909 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCNKO75909 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCNKO75909 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCNKO75909 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNKO75909 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNKO75909 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNKO75909 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNKO75909 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNKO75909 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCNKO75909 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCNKO75909 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCNKO75909 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCNKO75909 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCNKO75909 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCNKO75909 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNKO75909 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCNKO75909 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNKO75909 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCNKO75909 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCNKO75909 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNKO75909 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCNKO75909 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCNKO75909 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNKO75909 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNKO75909 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNKO75909 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNKO75909 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNKO75909 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNKO75909 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNKO75909 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNKO75909 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNKO75909 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNKO75909 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNKO75909 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNKO75909 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNKO75909 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNKO75909 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNKO75909 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNKO75909 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNKO75909 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNKO75909 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNKO75909 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNKO75909 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNKO75909 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNKO75909 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNKO75909 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNKO75909 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNKO75909 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNKO75909 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNKO75909 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNKO75909 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNKO75909 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNKO75909 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNKO75909 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNKO75909 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNKO75909 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNKO75909 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNKO75909 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNKO75909 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNKO75909 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNKO75909 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNKO75909 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNKO75909 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNKO75909 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNKO75909 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNKO75909 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNKO75909 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNKO75909 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNKO75909 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNKO75909 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNKO75909 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms