Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SPDYE4A6NLX3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPDYE4A6NLX3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SPDYE4A6NLX3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SPDYE4A6NLX3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPDYE4A6NLX3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SPDYE4A6NLX3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SPDYE4A6NLX3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SPDYE4A6NLX3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SPDYE4A6NLX3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SPDYE4A6NLX3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SPDYE4A6NLX3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SPDYE4A6NLX3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SPDYE4A6NLX3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SPDYE4A6NLX3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SPDYE4A6NLX3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SPDYE4A6NLX3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SPDYE4A6NLX3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SPDYE4A6NLX3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SPDYE4A6NLX3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SPDYE4A6NLX3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SPDYE4A6NLX3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SPDYE4A6NLX3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SPDYE4A6NLX3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SPDYE4A6NLX3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SPDYE4A6NLX3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SPDYE4A6NLX3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPDYE4A6NLX3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPDYE4A6NLX3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPDYE4A6NLX3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPDYE4A6NLX3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPDYE4A6NLX3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPDYE4A6NLX3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPDYE4A6NLX3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPDYE4A6NLX3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPDYE4A6NLX3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPDYE4A6NLX3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPDYE4A6NLX3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPDYE4A6NLX3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPDYE4A6NLX3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPDYE4A6NLX3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SPDYE4A6NLX3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPDYE4A6NLX3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPDYE4A6NLX3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPDYE4A6NLX3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPDYE4A6NLX3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SPDYE4A6NLX3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPDYE4A6NLX3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SPDYE4A6NLX3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SPDYE4A6NLX3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPDYE4A6NLX3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPDYE4A6NLX3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SPDYE4A6NLX3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPDYE4A6NLX3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPDYE4A6NLX3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPDYE4A6NLX3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SPDYE4A6NLX3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SPDYE4A6NLX3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SPDYE4A6NLX3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SPDYE4A6NLX3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SPDYE4A6NLX3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SPDYE4A6NLX3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SPDYE4A6NLX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPDYE4A6NLX3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SPDYE4A6NLX3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SPDYE4A6NLX3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SPDYE4A6NLX3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SPDYE4A6NLX3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SPDYE4A6NLX3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SPDYE4A6NLX3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SPDYE4A6NLX3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SPDYE4A6NLX3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SPDYE4A6NLX3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SPDYE4A6NLX3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPDYE4A6NLX3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SPDYE4A6NLX3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SPDYE4A6NLX3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPDYE4A6NLX3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPDYE4A6NLX3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPDYE4A6NLX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPDYE4A6NLX3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPDYE4A6NLX3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SPDYE4A6NLX3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SPDYE4A6NLX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SPDYE4A6NLX3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SPDYE4A6NLX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPDYE4A6NLX3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPDYE4A6NLX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SPDYE4A6NLX3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPDYE4A6NLX3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SPDYE4A6NLX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPDYE4A6NLX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms