Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N4

TRBV25-1, T-cell receptor beta variable 25-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV25-1A0A075B6N4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV25-1A0A075B6N4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV25-1A0A075B6N4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV25-1A0A075B6N4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRBV25-1A0A075B6N4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV25-1A0A075B6N4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV25-1A0A075B6N4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV25-1A0A075B6N4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV25-1A0A075B6N4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV25-1A0A075B6N4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV25-1A0A075B6N4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV25-1A0A075B6N4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV25-1A0A075B6N4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV25-1A0A075B6N4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV25-1A0A075B6N4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV25-1A0A075B6N4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV25-1A0A075B6N4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV25-1A0A075B6N4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBV25-1A0A075B6N4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV25-1A0A075B6N4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV25-1A0A075B6N4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV25-1A0A075B6N4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV25-1A0A075B6N4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV25-1A0A075B6N4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRBV25-1A0A075B6N4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV25-1A0A075B6N4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV25-1A0A075B6N4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV25-1A0A075B6N4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV25-1A0A075B6N4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV25-1A0A075B6N4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV25-1A0A075B6N4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV25-1A0A075B6N4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV25-1A0A075B6N4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV25-1A0A075B6N4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV25-1A0A075B6N4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV25-1A0A075B6N4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV25-1A0A075B6N4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRBV25-1A0A075B6N4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV25-1A0A075B6N4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV25-1A0A075B6N4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV25-1A0A075B6N4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV25-1A0A075B6N4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV25-1A0A075B6N4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV25-1A0A075B6N4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV25-1A0A075B6N4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV25-1A0A075B6N4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV25-1A0A075B6N4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV25-1A0A075B6N4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV25-1A0A075B6N4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV25-1A0A075B6N4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV25-1A0A075B6N4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV25-1A0A075B6N4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV25-1A0A075B6N4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV25-1A0A075B6N4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV25-1A0A075B6N4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRBV25-1A0A075B6N4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV25-1A0A075B6N4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV25-1A0A075B6N4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV25-1A0A075B6N4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV25-1A0A075B6N4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV25-1A0A075B6N4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV25-1A0A075B6N4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV25-1A0A075B6N4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV25-1A0A075B6N4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV25-1A0A075B6N4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRBV25-1A0A075B6N4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRBV25-1A0A075B6N4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRBV25-1A0A075B6N4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRBV25-1A0A075B6N4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV25-1A0A075B6N4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRBV25-1A0A075B6N4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRBV25-1A0A075B6N4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRBV25-1A0A075B6N4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRBV25-1A0A075B6N4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRBV25-1A0A075B6N4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRBV25-1A0A075B6N4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRBV25-1A0A075B6N4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRBV25-1A0A075B6N4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV25-1A0A075B6N4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV25-1A0A075B6N4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRBV25-1A0A075B6N4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRBV25-1A0A075B6N4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRBV25-1A0A075B6N4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRBV25-1A0A075B6N4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRBV25-1A0A075B6N4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRBV25-1A0A075B6N4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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