Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTNAP2Q9UHC6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTNAP2Q9UHC6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms