Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDKN2A-AS1Q9UH64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN2A-AS1Q9UH64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms