Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PCGF6Q9BYE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PCGF6Q9BYE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PCGF6Q9BYE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PCGF6Q9BYE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
PCGF6Q9BYE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PCGF6Q9BYE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PCGF6Q9BYE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms