Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JPH3Q8WXH2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
JPH3Q8WXH2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JPH3Q8WXH2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JPH3Q8WXH2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.9 ms