Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYO1EQ12965 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYO1EQ12965 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYO1EQ12965 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYO1EQ12965 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms