Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP11P59045 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRP11P59045 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRP11P59045 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP11P59045 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP11P59045 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms